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數(shù)字PCR創(chuàng)新應(yīng)用 | 實(shí)現(xiàn)膽管細(xì)胞癌早期預(yù)警、復(fù)發(fā)監(jiān)測、預(yù)后評(píng)估和療效監(jiān)測

分類：行業(yè)資訊發(fā)布時(shí)間：2023-10-09 訪問量：628

膽管細(xì)胞癌

膽管細(xì)胞癌是一種起源于膽管上皮細(xì)胞且具有較高惡性程度的腫瘤，按其發(fā)生部位，可分為ICC、肝門部膽管癌及遠(yuǎn)端膽管癌，占所有消化道惡性腫瘤的3%，且近年來發(fā)病率和病死率仍呈上升趨勢。由于膽管癌早期缺乏典型臨床癥狀，且腫瘤呈浸潤性生長，易轉(zhuǎn)移，導(dǎo)致大部分膽管癌初診時(shí)已處于不可切除的晚期階段，已無法接受根治性手術(shù)治療，放、化療等傳統(tǒng)治療方式療效有限，ICC患者總體預(yù)后較差。

目前，臨床常用的影像學(xué)檢查尚不能準(zhǔn)確鑒別ICC與原發(fā)性硬化性膽管炎、肝內(nèi)膽管結(jié)石等疾病。而血清學(xué)指標(biāo)如糖類抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9，CA19-9)、癌胚抗原(carcinoembryonic antigen，CEA)等的敏感性、特異性均難以滿足臨床需求。

因此，研究人員通過建立KRAS G12D、TP53 C242S、IDH1 R132C突變數(shù)字聚合酶鏈反應(yīng)(dPCR)檢測平臺(tái)，并初步評(píng)估其檢測性能及臨床應(yīng)用價(jià)值，對(duì)ICC早期預(yù)警、復(fù)發(fā)監(jiān)測、預(yù)后評(píng)估及療效監(jiān)測等為實(shí)現(xiàn)ICC患者早診、早治、改善預(yù)后的提供有了有力的武器。

目前多采用腫瘤組織進(jìn)行基因檢測，然而，對(duì)于ICC來說，不僅腫瘤組織取材困難，且瘤內(nèi)異質(zhì)性高，不同位點(diǎn)僅有46.8%的突變基因一致率，一些常見突變基因如BRAF、KRAS、EGFR等在腫瘤組織中的檢出率均不足30%，且不同ICC患者的高頻突變基因譜也不盡相同。由此可見，單一、特定的突變標(biāo)志物在ICC診療中的作用有限，所以篩選我國ICC相關(guān)的突變基因并建立多個(gè)相關(guān)基因的診療譜具有重要意義。

循環(huán)腫瘤DNA（circulating tumor DNA，ctDNA）以其半衰期短、無創(chuàng)、可反映腫瘤原發(fā)灶整體突變負(fù)荷等優(yōu)勢為這些問題的解決帶來了希望。由于ctDNA僅占血漿循環(huán)DNA總量的1%，目前臨床常用的檢測技術(shù)無法對(duì)其準(zhǔn)確定量。

研究人員選取了2016年1月—2018年12月在復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院行切除手術(shù)的ICC患者22例作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，自行構(gòu)建了C242S、IDH1 R132C突變型及野生型質(zhì)粒。

他們將KRAS G12D、TP53 C242S和IDH1 R132C這3種突變命名為ctDNA突變譜。采用建立的ctDNA突變譜dPCR平臺(tái)檢測22例ICC患者和10例HCC患者、10名正常對(duì)照者外周血ctDNA突變情況，來評(píng)估該平臺(tái)的檢測效能。22例ICC患者術(shù)前外周血及腫瘤組織分別采用Oseq-ctDNA及Oseq-T靶向測序平臺(tái)（華大基因公司）檢測，評(píng)估這2種平臺(tái)與自建ddPCR平臺(tái)的一致性。

最終得出了，數(shù)字PCR平臺(tái)的功能靈敏度可達(dá)0.1%，與文獻(xiàn)報(bào)道一致。在0.1%～10.0%范圍內(nèi)該平臺(tái)的檢測結(jié)果呈線性，可對(duì)KRAS G12D、TP53 C242S、IDH1 R132C突變進(jìn)行準(zhǔn)確的定量檢測。

結(jié)果表明數(shù)字PCR平臺(tái)可用于定量檢測外周血ctDNA突變，適用于ICC患者的輔助診斷、術(shù)后療效評(píng)估及療效動(dòng)態(tài)監(jiān)測等。該平臺(tái)的建立有助于推動(dòng)ICC個(gè)體化治療的進(jìn)展，為臨床提供更準(zhǔn)確的患者基因突變信息。